Pētījumi Projekti Visi Projekti
Projekti

Ātrās saites

Genotipēšanas un sekvenēšanas pakalpojumi

Finansētājs: Latvijas Zinātnes padomes sadarbības projekts Nr. 10.0010.10. "Genetic investigation of disease aetiology, pathogenesis and ageing processes in the Latvian population"

Periods: 2010-2014

Apakšprojekta vadītājs: Dr. biol. Jānis Kloviņš

Mērķis

Nodrošināt genotipēšanas pakalpojumus visiem LZPSP 10.0010 apakšprojektiem

Uzdevumi

1. Valsts iedzīvotāju genoma datubāzes datu sagatavošana projekta dalībniekiem. Paredzēts vienas līdz divu nedēļu laikā nodrošināt fenotipisko datu atlasi un transformāciju nepieciešamajā formātā vismaz 5000 paraugiem pēc apakšprojektu dalībnieku pieprasījuma.

2. Valsts iedzīvotāju genoma datubāzes DNS/seruma sagatavošana 5000 paraugiem. Paredzēts 1-2 nedēļu laikā nodrošināt paraugu atlasi, DNS koncentrācijas normalizāciju un paraugu alikvotēšanu 96 bedrīšu platēs vai individuālos stobriņos. Pakalpojumu paredzēts piedāvāt bez maksas vai sedzot tikai materiālu izmaksas (atkarībā no apjoma)

3. Genotipēšanas serviss: a)nodrošināt 10000 MALDI-TOF genotipēšanas, b) nodrošināt 1000 taqMan reālā laika genotipēšanas, c)mikrosatelītu analīze ar ABI-PRISM3100 iekārtu pēc pieprasījuma.

4. Pilna apjoma un gatavu reakcijas produktu sekvencēšana vismaz 500 paraugiem izmantojot ABI PRISM3740.

Rezultāti

Tiek veiksmīgi nodrošināta genotipēšana LZPSP 10.0010 projekta dalībniekiem izpildot augstāk minētos uzdevumus



Mājas lapas izstrādi finansēja ERAF 2.1.1.2. aktivitātes projekts Nr. 2010/0196/2DP/2.1.1.2.0/10/APIA/VIAA/004 "Latvijas biomedicīnas pētījumu integrācija Eiropas zinātnes telpā".